و إذا الشيء زاد عن حدّه ينقلب إلى ضده، الحال كذلك أيضا بالنسبة لخبز البروتين فله أضرار محتملة ناتجة عن زيادة البروتين عن الحد المسموح به، إذ بالإمكان ان يتسبب في زيادة الضغط على الكلى، و إفراز الكلى للكالسيوم أكثر من المعتاد مما يتسبب في هشاشة العظام وزيادة فرصة ان تكون حصوات الكلى في المسالك البولية.
زيادة تناول خبز البروتين من غير ممارسة أي نشاط بدني يتسبب أيضا بتخزين كميات البروتين في الجسم على شكل دهون بالإضافة الى إمكانية أن يعاني الأشخاص الذين لديهم حساسية الغلوتين من رد فعل تحسسي عند تناول خبز البروتين.